忙しい仕事の合間を縫って、やっとこさトロコンしました。

いくつかやり方を知っていると時短できる作業などがあるので記載します。
流星のロックマン
基本的にはエンカウントなし設定でメインストーリーを駆け抜け、クリア後にウォーロック装備のゼニーサーチング、コレクトバイザーを切り替えてチップ集めを行なう方法で詰まることなくコンプできると思います。
ボスのEX,SPカード集めでのSPボス狩りは、エンカウントしたらサブカードのサーチアイを使ってセーブすることで、エンカウント率を上げた状態でリセマラができるので活用するといいでしょう。
また、全作品でR3を押すことでエリアを見渡すことができるので、面倒なギミックや行き止まりの道に時間を食う際に役立ちます。
流星のロックマン2
全チップの威力が2倍になるトライブキングをバトル開始から使えるウェーブコマンドカードがあるため、パフェコレ化で最もバランスが崩れています。
火力2倍化した属性ギガクラスカードで弱点をつけば、ほとんどのボスをワンパンできるため、SPボス討伐は一番簡単です。
逆にEXカード入手のためのバスティングレベル調整が難しいかも。
この作品で他に特筆すべきことはないです。
流星のロックマン3
改造による強化にクセがあるため、前2作品ほどはサクサク進まないと思います。
また、ギガクラスカードのうち一枚のために500回の戦闘が必要になるため、流星3ではなるべくエンカウント率を低くする機能は使わないほうがいいかもしれません。
今回はほとんどの初回ボス戦(アシッドエース、グレイブジョーカー、隠しボス以外)でボスカードがドロップできるため、V2ボスからV2カード、暗号でV3カードを集めることで、メガクラス集めは多少楽ができます。
V3ボスからV2カードを集める場合、戦闘時にのけぞったかどうかでバスティングレベルが大きく変わってくるので、ノイズドカードのオックス・ファイアノイズについているスーパーアーマーを有効化するなどしてバスティングレベルを9〜10に調整しながら集めましょう。
・アシッドエースBB、グレイブジョーカーRR撃破
オリジナルではオンライン対戦連戦時に乱入でしたが、パフェコレではFM星のコスモウェーブ3の両脇にそれぞれ固定シンボル配置されています。
・Ωボス撃破
ウェーブロードを歩いていると稀にWarning Bell!!(Ver.RR3)のBGMが流れることがあります。
このときWarning状態で戦闘に入ると必ずΩボスとの戦闘になります。
発生率はごくわずかで、自分もトロコンまでに3〜4回程度しか見かけなかったので、発生したら必ず戦闘しておいた方がいいでしょう。
自分はオリジナル版をプレイしていたときに見かけたことがなかったので、BGM再生管理バグかと思って2回ほどスルーしてしまいました…。
単純に二つのエリアを行ったり来たりするだけでは発生しないようで、
コダマ小学校のおくじょう〜シーサーアイランドのビーチの往復が最も効率がいいようです。
おくじょう or ビーチに到達したらウェーブステーションでウェーブロードから降りて電波変換解除、再度電波変換してウェーブロードに上がることでマラソンができます。
また、特に他のトロフィーの条件には絡んでこないので、一度倒したらそれきりで問題ないです。
・ノイズのかけら集め
スタンダード、ギガクラスコンプに最低45個必要です。
① クリア後ブライノイズにチェンジ(フォームアウト時ソード系+50)
② フォルダにビーストスイング2以上を入れられるだけ入れ、ダブルイーターをレギュラーに設定
③ 校門の電脳で、バルカンを撃ってくる敵3体の配置に遭遇したらダブルイーター + ビーストスイングを撃つだけ。
開始時50%を合わせてノイズ率440%以上、Sランクで報酬が3枠になるので、効率よく集めることができます。
高いノイズ率で連勝すればかけらのドロップ率が上がるそうなので、45個集まるまでそれを繰り返します。
・ノイズ率500%以上の状態でファイナライズ
シリーズ通して凶悪なパラライズステージ+ホワイトorシルバーorプラチナメテオのコンボを使います。
ノイズドカードのクラウン・サンダーノイズには、バトルカードのサポートユーズがパラライズステージになるアビリティがついてるので有効化しておくと便利です。
体力の多いボス戦でパラライズステージ + 適当な攻撃カードで敵の足を止め、そこにメテオを使えば簡単にノイズ率500%を超えると思うので、
カード選択画面からメテオサーバーアクセスを実行すれば取得です。
どの作品でも
・一番手前の横3マスの中でエネミーをデリートする
条件としてはロックマンのいる列に敵が来たときにデリートです。
オックス・ファイアのタックル最後にキグナス・ウイングやタイフーンダンス、ネバーレインなどを当てるのが簡単そうです。